La selezione di un FFU comprende considerare i vari criteri quale la dimensione dell'ambiente controllato, del tasso richiesto del flusso d'aria, della capacità del filtro e dell'a filtro. La dimensione del FFU dovrebbe essere selezionata in base alla dimensione della stanza e del tasso richiesto del flusso d'aria. La capacità del filtro e l'a filtro dovrebbero essere selezionati in base ai requisiti di applicazione.

I vantaggi di usando un FFU sono molti. Fornisce l'aria pulita, migliora la qualità dell'aria, riduce il rischio di contaminazione ed aumenta l'efficienza di altri sistemi di filtrazione dell'aria nella costruzione. È inoltre facile da installare e mantenere e viene con un tempo di impiego lungo. FFUs può essere utilizzato nelle varie applicazioni, compreso le stanze pulite, i laboratori, gli ospedali e le istallazioni industriali.

Le limitazioni di usando un FFU comprendono l'alto costo iniziale, l'esigenza di manutenzione regolare e la capacità limitata di filtrazione. FFUs non può essere adatto ad applicazioni con gli alti livelli di inquinamento atmosferico, delle temperature estreme, o dell'umidità. È importante selezionare un FFU che è appropriato per l'applicazione e la mantiene secondo le istruzioni del produttore.